上海交大校史博物馆设在老图书馆二、三楼，展厅总面积约600多平方米。 校史博物馆共有三个展厅。第一展厅的时间跨度从创办南洋公学直至上海解放，内分三个时期，即(一)南洋公学初创(1896-1906年)；(二)创建现代工科大学(1906-1927年)；(三)理工管结合的交通大学(1928-1949年)。第二展厅的时间跨度从上海解放至今，也分三个时期，分别是(一)建设多学科的新型大学(1949-1960年)；(二)建设国防工业院校(1960-1978年)；(三)建设以工科为主的多科性大学(1979-1997年)。这两个展厅共展出珍贵文物、文献、照片资料等近700件，反映了学校一个世纪来的发展历程和学研昌盛的丰硕成果。第三展厅为上海交大“两院”院士图片资料展和林同炎教授展览室，“两院”院士展展出了目前搜集到的108位在交大求学或任教过的中国科学院和工程院院士的照片资料等，以院士们的出生年月先后为排列顺序，着重介绍他们的生平简历与主要成就。林同炎展室展出了交大著名校友、国际知名结构工程学家、教育家、美籍华裔学者林同炎先生的照片、著作、论文、图片资料等共300余件。 校史博物馆于1996年4月8日交大百年校庆之际开馆，开馆以来，每年接待了五万余名参观者。96年4月29日，江泽民总书记回母校参观了校史博物馆，并题写了馆名。1996年11月，校史博物馆被命名为“上海市青少年教育基地”。 校史博物馆有多名兼职讲解员和有关的书面介绍材料，开放时间一般为每周一、三、五下午2:00~4:00，接收预约，欲参观者请与档案馆档案科学与史料应用研究室联系，电话为62813034。
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